Με απόφαση του Δημοτικού Συμβουλίου Ρόδου, η διαχείριση της Κοιλάδας των Πεταλούδων παραχωρείται επ’ αόριστον στη ΔΕΡΜΑΕ. Ο φορέας, που εδώ και περίπου μία δεκαετία έχει αναλάβει τη συντήρηση και τον ευπρεπισμό του μνημείου, έχει αναπτύξει τις απαραίτητες υποδομές και τεχνογνωσία για τη σύγχρονη διαχείρισή του.
Σύμφωνα με το άρθρο 36 του ν. 4049/2012, η κυριότητα της Κοιλάδας των Πεταλούδων μεταβιβάστηκε από τον ΕΟΤ στον Δήμο Ρόδου, χωρίς αντάλλαγμα. Η παραχώρηση καλύπτει δασική έκταση 600.000 τ.μ., όπως ορίζεται στο τοπογραφικό διάγραμμα του ΕΟΤ (αρ. 587/2/22584/7-8-1969).
Η ΔΕΡΜΑΕ έχει αναλάβει πλήρως τη συντήρηση, φύλαξη και αξιοποίηση του φυσικού μνημείου, βελτιώνοντας τη λειτουργία του και αναβαθμίζοντας τις υποδομές και τις υπηρεσίες του. Η συνολική διαχείρισή του από τον φορέα έχει συμβάλει στην αντιμετώπιση προβλημάτων που υπήρχαν στο παρελθόν, διασφαλίζοντας τη βιώσιμη ανάπτυξη και προστασία της Κοιλάδας.